วิสัยทัศน์ (Vision)

     เป็นองค์กรหลักด้านการศึกษา วิจัยและพัฒนาสมุนไพรและการแพทย์แผนไทยของประเทศไทย 

พันธกิจ (Mission)

     1. วิจัยเชิงวิทยาศาสตร์ทางคลินิก และพรีคลินิก ด้านการแพทย์แผนไทย

     2. เป็นศูนย์กลางข้อมูลการวิจัยด้านการแพทย์แผนไทยโดยมีระบบสารสนเทศที่มีเครือข่ายทั้งในประเทศและต่างประเทศ เพื่อประโยชน์เชิงนโยบาย ยุทธศาสตร์และการบริการผู้ที่เกี่ยวข้อง

     3. สร้างความร่วมมือในการวิจัยด้านการแพทย์แผนไทย ทั้งในและต่างประเทศ

     4. รวบรวมและจัดทำตัวอย่างมาตรฐานสมุนไพรที่ใช้ในตำรับยาแผนไทย รวมทั้งสมุนไพรหายาก ใกล้สูญพันธุ์และมีคุณค่าทางเศรษฐกิจเพื่อเป็นแหล่งอ้างอิง

     5. บริการตรวจสอบชนิดและเทียบเคียงตัวอย่างสมุนไพรที่ใช้ในตำรับยาแผนไทย

     6. ปฏิบัติงานร่วมกับหรือสนับสนุนการปฏิบัติงานของหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้องหรือที่ได้รับมอบหมาย

แผนยุทธศาสตร์ 

ยุทธศาสตร์ที่ 1 วิจัยพัฒนาระบบและกลไกการจัดการงานวิจัยด้านการแพทย์แผนไทย

ยุทธศาสตร์ที่ 2 วิจัยพัฒนานักวิจัยและเครือข่ายนักวิจัยด้านแพทย์แผนไทย

ยุทธศาสตร์ที่ 3 วิจัยพัฒนางานวิจัยให้เกิดศักยภาพเพื่อการนำแพทย์แผนไทยไปใช้ประโยชน์ในระบบบริการสุขภาพ